定性的または定量的なファーマコフォアモデルを自動的に作成し、ターゲットへの結合に必要である基本的な化学的特性や構造的特性を識別できます。ユーザは既知の一連の化合物から自動的に仮説を作り上げることが可能です。不活性分子の構造から、立体障害の存在を予測し、排除体積を規定してモデルを改良できます。また、医薬品候補や既知の活性化合物のアラインメントをもとに、生理活性を考慮せずにファーマコフォアの仮設を展開することもできます。
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