複雑な生体分子系をモデリングして把握するためには、分子シミュレーションが必要不可欠です。BIOVIA の予測科学アプリケーション、Discovery Studio® の最新のリリースには、市販のソフトウェアで初となる Multi-Site Lambda Dynamics などの新しい科学的成果が盛り込まれています。BIOVIA Pipeline Pilot ™ をベースにして構築されたDiscovery Studio は、ライフサイエンスの創薬研究分野に最適な、さまざまな機能を網羅したコラボレーティブなモデリング・シミュレーション・アプリケーションです。
Discovery Studio 2020 は、バージョン 2020 としてリリースされた一連の BIOVIA 製品の一つで、バイオ医薬品やシミュレーション、低分子研究などの分野における重要な科学的進展が実装されています。
図1:MSLD シミュレーション用に Hsp90 結合部位の内部で
1つのコアと 2つの部位で定義されたコンビナトリアル・ライブラリ
新機能! GPU と CPU の両方で CHARMm-DOMDEC を介したMulti-Site Lambda Dynamics1 メソッドを搭載し、初期のリード最適化段階で大規模な同族化合物ライブラリの探索が可能になりました。
新機能! 生物製剤の溶解度や粘度を予測できるようになりました。
図2:POPC 二重層膜で溶媒和されたhERG イオンチャネル
新機能! 露わな膜を含む分子動力学シミュレーションに対応しました。
機能強化! タンパク質のモデリング・シミュレーション機能を多方面から強化しました。
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新機能! 以下のファーマコフォア生成方法が強化されました。
図3:非結合相互作用の特徴認識「相互作用ファーマコフォア」と
一致する「非結合の特徴認識」相互作用ファーマコフォア
機能強化! ファーマコフォア・モデリング機能を多方面から強化しました。
機能強化!
Discovery Studio 2020 は BIOVIA Pipeline Pilot 2020 をベースにして構築されています。
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