分子シミュレーション＆インフォマティクス 用語解説
タンパク質 [たんぱくしつ] [protein]
約20種類のL-α-アミノ酸からなるポリペプチドを主体とする高分子化合物の総称。組成の上から、アミノ酸だけからなる単純タンパク質と、核酸・リン酸・脂質・糖・金属などを含む複合タンパク質とに分けられる。また、分子の形状から、繊維状タンパク質と球状タンパク質とに分類される。種類・機能はきわめて多種多様で、生体内の化学反応の触媒となる各種の酵素、生物体を構成するもの（コラーゲンなど）、運動をつかさどるもの（アクチン・ミオシンなど）、各種のホルモンや抗体など、いずれも生命現象に本質的な役割を果たす。
- 「タンパク質」に関連する分子シミュレーションソフト
ADMET Descriptors：ADMET特性向上のための分子設計支援
CFF Advanced Class II Forcefield：DNA、RNA、炭水化物、脂質、タンパク質等のモデルを最適化
DS Analysis：MDトラジェクトリを解析
DS Biopolymer：タンパク質モデリングツール
DS CHARMm：分子のエネルギーやダイナミクスを計算
DS LigandScore：リガンド-タンパク質の相互作用を評価
DS MODELER：ホモロジーモデリングツール
DS Protein Aggregation：タンパク質上の凝集しやすい部位の大きさと場所を特定
DS Protein Docking：タンパク質-タンパク質構造の相互作用を予測
DS Protein Families：タンパク質ファミリーでの配列保持パターンを解析
DS Protein Health：モデリング研究や実験データから得られるタンパク質構造の有効性を評価
DS Protein Refine：タンパク質構造のループ領域を最適化
DS Protein Refine：タンパク質構造のループ領域を最適化
DS Sequence Analysis：対象になる配列と既知タンパク質の配列を比較